Bölüm anahatları
-
Dersin amacı: Ders, hücre fabrikaların oluşturulması için biyolojik modül ve sistemlerin tasarım ve inşasının bilimsel ve teknik temellerini konu almaktadır.
Dersin içeriği: Hücre fabrikaların oluşturulması amacı ile hücre fonsiyonlarının ve metabolizmasının yeniden programlanmasında kullanılan geleneksel evrimsel yöntemler, rasyonel ve sistem tabanlı yaklaşımlar konu edilmektedir. Biyoproses tasarım ve optimizasyonunda kullanılan matematiksel ve enstrumental yöntemler tanıtılmaktadır. Bu bağlamda, antimkrobiyal, aşı ve çeşitli biyolojik terapötiklerin üretimi tartışılmaktadır.
-
Farklı organizma sınıfları için saklama yöntemleri, saklama yöntemlerinin etkinliğinin omik yaklaşımlar ile değerlendirilmesi
-
Sentetik ve sistem biyolojisi yöntemleri kullanarak, biyoteknoloji için yeni gen kaynaklarının keşfi. Vaka analizi: Waksman platformu 2.0
-
Geleneksel yöntemler, rassal mutagenez, hücre fabrika olarak kullanılacak mutantların seçilmesi ve stabilize edilmesine yönelik yaklaşımlar.
-
Hücre fabrikaların oluşturulmasında rasyonel tasarım araçları ve yöntemleri.
-
Nükleik asit ve peptid sentez kimyaları ve otomasyonu
-
Hücresiz ifade sistemlerinden sentetik hücre üretimine uzanan geniş bir yelpazede yer alan biyolojik fabrika sistemleri
-
Matematiksel ve istatistiksel yöntemler ile optimizasyon, DoE uygulamaları
-
Kontrol sistemleri, ölçüm yöntemleri, ölçülebilenler, ölçülemeyenler ve matematiksel modelleme
-
Hücre fabrikaların tasarım, optimizasyon ve üretim süreçlerinde karmaşık sistem modelleme yöntemleri, metabolik akı analizi
-
Dinamik sistemler ve kaos teorisi.
-
Verilerden bilgeliğe giden yol – disbiyozların tedavisinde hedef seçimi, trendler ve gerçekler.
-
Biyoteknolojik ilaçlar perspektif ile immünolojik kavramlar.
-
Biyolojiklerin tasarım, uygulama ve üretim süreçlerinde kullanılan yöntemler.
-
Louis Pasteur’dan günümüze koruyucu ve tedavi edici aşılar.
